多肽(Peptide)是指生物活體中器官、組織、體液及細(xì)胞內(nèi)全部的內(nèi)源性多肽組分,同時也包括蛋白質(zhì)降解產(chǎn)生的或者具有特定活性的多肽,通常指的是含有2到50個氨基酸的多肽。多肽是在人體生理和病理中發(fā)揮重要作用的重要分子,在機(jī)體的生長發(fā)育和新陳代謝過程中起重要的調(diào)控作用,因此廣泛應(yīng)用在生物標(biāo)志物的篩選、疾病診斷與檢測、植物生長發(fā)育調(diào)控和食品等方面。
采用有機(jī)溶劑共沉淀和酸輔助再溶解方式提取生物多肽。使用tims TOF HT 4D-DDA 質(zhì)譜檢測技術(shù)進(jìn)行高通量的蛋白質(zhì)組學(xué)檢測。質(zhì)譜原始文件進(jìn)行de novo和基于數(shù)據(jù)庫的搜庫分析,并對數(shù)據(jù)進(jìn)行質(zhì)量控制、肽段理化性質(zhì)統(tǒng)計、差異肽段篩選和功能富集分析等。
篩選疾病相關(guān)的特征肽段,開發(fā)疾病早篩早診的標(biāo)志物
篩選疾病關(guān)鍵肽段導(dǎo)致疾病發(fā)生發(fā)展的機(jī)制研究
篩選入藥動植物的活性肽段
通過食品中特殊肽評價食品加工工藝和食品安全
青蓮百奧特色分析內(nèi)容:
預(yù)測肽段活性:一來可以驗(yàn)證搜庫的準(zhǔn)確性,二來可以將之與相關(guān)前體蛋白生物活性的結(jié)構(gòu)域相匹配,從而預(yù)測其在前體蛋白中的定位和功能。
基于功能肽庫對肽段注釋:功能肽是在體內(nèi)擔(dān)負(fù)著重要調(diào)節(jié)功能的肽類物質(zhì),與生命體的生長、代謝、免疫、信號傳導(dǎo)等生理活動息息相關(guān)。通過功能肽庫注釋幫助發(fā)現(xiàn)樣本中的功能肽段。
蛋白質(zhì)從頭測序技術(shù)(De Novo Sequencing)是利用串聯(lián)質(zhì)譜(MS/MS)獲取離子,根據(jù)兩個片段離子之間的質(zhì)量差來計算肽鏈上氨基酸殘基的質(zhì)量,從而得到蛋白的氨基酸序列的分析過程。De novo分析的優(yōu)勢在于不需要依賴任何數(shù)據(jù)庫,就可對已知蛋白或未知蛋白進(jìn)行序列分析。
參考多篇文獻(xiàn)總結(jié)并測試出最優(yōu)多肽提取方案。
提取效率高,鑒定深度高,助力新肽的發(fā)現(xiàn)
共計完成項目100+
完成物種類型30+
合作單位40+
發(fā)表期刊:Theranostics
影響因子:12.4
發(fā)表單位:浙江大學(xué)
發(fā)表時間:2023.05.21
樣本類型 | 樣本來源 | 送樣量 |
動物組織 | 常規(guī)組織(腦、心、肝、肺、腎、肌肉等柔軟組織) | 50mg |
堅硬組織(軟骨、毛發(fā)) | ||
植物組織 | 柔軟組織(木本植物的也、花等,草本植物,藻類,蕨類植物) | 500mg |
堅硬組織(根、樹皮、樹枝,果實(shí)種子等) | / | |
微生物 | 常見細(xì)菌、真菌菌體(菌體沉淀) | 200μL |
細(xì)胞 | 懸浮/貼壁培養(yǎng)細(xì)胞(細(xì)胞計數(shù)/沉淀) | 107 |
液體類 | 血漿/血清/腦脊液 | 100μL |
多肽組學(xué)是指以機(jī)體內(nèi)源性多肽為研究對象,進(jìn)行全面的定性和定量的分析,研究多肽組的結(jié)構(gòu)、功能、變化規(guī)律及其相關(guān)關(guān)系。多肽組學(xué)和蛋白組學(xué)都是基因組學(xué)的補(bǔ)充,被稱為事連接蛋白組和代謝組的橋梁。
青蓮百奧采取有機(jī)溶劑結(jié)合酸提取的方式純化樣本中的多肽。
1)獨(dú)特提取方法(多肽提取效率高)
2)特色數(shù)據(jù)分析(預(yù)測肽段活性、基于功能肽庫對肽段注釋)
3)肽段注釋全面(同時提供De novo和Database的肽段信息)
4)項目經(jīng)驗(yàn)豐富(不同物種和組織類型實(shí)測數(shù)據(jù))
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