親愛的科研伙伴們，青蓮百奧在此向您展示我們的創(chuàng)新產(chǎn)品——免疫肽組學(xué)。我們專注于利用尖端的質(zhì)譜技術(shù)和生物信息學(xué)工具，為腫瘤免疫治療和疫苗研發(fā)提供深度解析和個性化解決方案。

什么是免疫肽組學(xué)

免疫肽組是指對有核細(xì)胞在參與抗原呈遞途徑中的 MHC I 類或 II 類蛋白質(zhì)上呈遞的全部多肽的研究，對于探究細(xì)胞介導(dǎo)和體液反應(yīng)介導(dǎo)的免疫原性表位至關(guān)重要。

圖1：MHC I類和II類抗原呈遞途徑¹

青蓮百奧技術(shù)流程

青蓮百奧已推出專門檢測免疫肽組學(xué)的一套完整方案。通過MHC抗體富集MHC及其結(jié)合肽，使用高深度質(zhì)譜儀tims TOF HT進(jìn)行檢測。隨后采用peaks獨(dú)有的Deep novo深度測序技術(shù)，通過連續(xù)迭代預(yù)測氨基酸，從而從串聯(lián)質(zhì)譜（MS/MS）數(shù)據(jù)中重建多肽序列。不需要序列數(shù)據(jù)庫，因此可以從質(zhì)譜數(shù)據(jù)中預(yù)測未知多肽的氨基酸序列，有助于發(fā)現(xiàn)新抗原、開發(fā)疫苗以及推進(jìn)癌癥免疫治療。

圖2：青蓮百奧免疫肽組學(xué)技術(shù)流程

青蓮百奧技術(shù)優(yōu)勢

應(yīng)用場景

免疫肽組學(xué)作為腫瘤免疫治療領(lǐng)域的前沿技術(shù)，通過高通量鑒定腫瘤特異性抗原肽段，為個性化癌癥疫苗和細(xì)胞療法的開發(fā)提供了關(guān)鍵信息。它揭示了腫瘤細(xì)胞如何通過調(diào)節(jié)MHC分子的表達(dá)來逃避免疫系統(tǒng)的監(jiān)視，從而為設(shè)計新的免疫治療策略提供了分子層面的見解。

應(yīng)用案例：腫瘤-免疫治療

2023年11月，芬蘭加赫爾辛基大學(xué)團(tuán)隊(duì)基于免疫肽組學(xué)鑒定了小鼠（AB12 細(xì)胞系）和人細(xì)胞系（H28、MSTO-211H、H2452 和 JL1）以及患者原發(fā)腫瘤中惡性胸膜間皮瘤（MPM）的免疫肽組學(xué)抗原呈現(xiàn)情況。該研究通過PeptiCRAd技術(shù)包被篩選的兩個免疫肽，對小鼠進(jìn)行免疫治療。結(jié)果表明其有效誘導(dǎo)了抗腫瘤免疫反應(yīng)，抑制了荷瘤小鼠AB12腫瘤生長。綜上所述，免疫肽組學(xué)可以用于間皮瘤治療性癌癥疫苗的研發(fā)。

圖4：惡性胸膜間皮瘤免疫組學(xué)檢測²

應(yīng)用案例：感染疾病-抗原篩選

2021年7月，麻省理工學(xué)院和哈佛大學(xué)布羅德學(xué)院團(tuán)隊(duì) 用嚴(yán)重急性呼吸系統(tǒng)綜合征冠狀病毒2（SARS-CoV-2）感染兩個細(xì)胞系，并使用質(zhì)譜法檢測其免疫肽。該研究發(fā)現(xiàn)HLA-I肽不僅來源于經(jīng)典開放閱讀框（ORF），而且來源于當(dāng)前疫苗未捕獲的刺突和核衣殼中的內(nèi)部框外ORF。在人源化小鼠模型和患有新冠肺炎的個體中，來自框架外ORF的免疫肽引發(fā)了T細(xì)胞反應(yīng)，甚至超過了2021年報道的一些T細(xì)胞表位。這些結(jié)果將有助于選擇用于免疫監(jiān)測和疫苗開發(fā)的肽。

圖5：SARS-CoV-2免疫肽組學(xué)檢測³

參考文章

1. Purcell AW, Ramarathinam SH, Ternette N. Mass spectrometry-based identification of MHC-bound peptides for immunopeptidomics. Nat Protoc. 2019;14(6):1687-1707. doi:10.1038/s41596-019-0133-y

2. Chiaro J, Antignani G, Feola S, et al. Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors. Nat Commun. 2023;14(1):7056. Published 2023 Nov 3.

3. Weingarten-Gabbay S, Klaeger S, Sarkizova S, et al. Profiling SARS-CoV-2 HLA-I peptidome reveals T cell epitopes from out-of-frame ORFs. Cell. 2021;184(15):3962-3980.e17. doi:10.1016/j.cell.2021.05.046