血漿蛋白質(zhì)組是最復(fù)雜的人類蛋白質(zhì)組，具有極高的臨床轉(zhuǎn)化價值。血漿蛋白豐度范圍廣泛，其中22種高豐度蛋白占比超過99%，低豐度蛋白占比少于1%，但低豐度蛋白在疾病早期診斷、預(yù)后治療、生物標(biāo)志物研究方面具有重要研究價值。

青蓮百奧自主研發(fā)了低豐度蛋白富集磁珠試劑盒（MagicOmics-DMB），可獲得低至pg/ml濃度的生物標(biāo)志物檢測，助力血液蛋白質(zhì)組學(xué)研究。2023年青蓮百奧與中國人民解放軍總醫(yī)院李芮冰主任團(tuán)隊合作于《Analytica Chimica Acta》發(fā)表DMB助力神經(jīng)疾病診斷標(biāo)志物開發(fā)的研究。目前DMB材料已廣泛應(yīng)用，并于近日被國家計量院驗(yàn)證。

技術(shù)驗(yàn)證：國家計量院認(rèn)證青蓮百奧低豐度蛋白富集技術(shù)

近日，國家計量院基于肝癌的血清樣本對比了Top14高豐度蛋白去除試劑盒和青蓮百奧低豐度蛋白富集試劑盒（DMB）去除血清蛋白質(zhì)組高豐度的效果[1]。結(jié)果表明DMB處理后的蛋白鑒定量在對照樣本和疾病樣本中分別是Top14的2.6和3.7倍，且DMB處理后低豐度蛋白質(zhì)的鑒定覆蓋率更高。差異蛋白及其功能和通路富集結(jié)果更豐富，有助于探究生物學(xué)現(xiàn)象并篩選標(biāo)志物。

圖1：不同試劑盒處理后蛋白質(zhì)和多肽的鑒定^[1]

應(yīng)用驗(yàn)證:青蓮百奧DMB助力神經(jīng)疾病診斷標(biāo)志物開發(fā)

2023年8月，青蓮百奧CTO趙焱博士與中國人民解放軍總醫(yī)院李芮冰主任團(tuán)隊合作的血漿蛋白質(zhì)組最新成果“基于納米材料蛋白冠血漿蛋白質(zhì)組學(xué)深度挖掘策略的建立及臨床應(yīng)用評價”見刊《Analytica Chimica Acta》^[2]。該研究利用DMB磁珠富集低豐度蛋白質(zhì)47例臨床血漿（24例對照，23例疾?。?。兩組人群臨床免疫指標(biāo)沒有顯著差異，但兩組人群血漿蛋白質(zhì)量有顯著差異。通過血漿蛋白質(zhì)組鑒定出18種與神經(jīng)系統(tǒng)疾病相關(guān)或腦組織特異性表達(dá)的差異蛋白，并交叉驗(yàn)證了ENPP2和SLC2A1/Glut1蛋白的ELISA結(jié)果，證明了臨床生物標(biāo)志物研究的可行性。

圖2 DMB助力血漿蛋白質(zhì)組研究策略

青蓮百奧致力打造更完善血漿蛋白質(zhì)組解決方案

去年，青蓮百奧將自主研發(fā)的血漿低豐度蛋白富集磁珠試劑盒、全流程自動化前處理機(jī)器人和高通量tims TOF HT質(zhì)譜儀結(jié)合，克服血漿樣品復(fù)雜性高、低豐度蛋白檢測深度低的難題，成功將血漿蛋白質(zhì)組的檢測深度提升至6000＋，為血漿蛋白質(zhì)組學(xué)研究帶來革命性的突破！

圖3 青蓮百奧血漿蛋白質(zhì)組實(shí)測數(shù)據(jù)

 近日，青蓮百奧進(jìn)一步開發(fā)了血漿特色分析并搭建了基于機(jī)器學(xué)習(xí)的疾病標(biāo)志物發(fā)現(xiàn)平臺。該流程整合了九大篩選模型，通過模型評分選擇最優(yōu)模型，利用最優(yōu)模型篩選潛在生物標(biāo)志物，建立預(yù)測模型進(jìn)行效果評估。這一流程能夠?yàn)榕R床提供早診、早篩生物標(biāo)志物，助力精準(zhǔn)醫(yī)療。

北京青蓮百奧生物科技有限公司是一家專注于蛋白質(zhì)組學(xué)檢測的創(chuàng)新性平臺型CRO企業(yè)，以臨床需求為導(dǎo)向、以源頭創(chuàng)新為核心驅(qū)動力，為蛋白質(zhì)診療標(biāo)志物的臨床轉(zhuǎn)化提供一站式的完整解決方案。擁有蛋白樣本的獨(dú)創(chuàng)性納米磁珠富集技術(shù)、全流程前處理智能機(jī)器人及全自動大數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)。我們聚焦于血液、外泌體、組織切片、單細(xì)胞等樣品，攻克微量檢測限制、高深度覆蓋、定量準(zhǔn)確性、方法標(biāo)準(zhǔn)化、算法智能化等蛋白質(zhì)檢測關(guān)鍵技術(shù)環(huán)節(jié)，全力打造新一代蛋白質(zhì)組學(xué)平臺。

【參考文獻(xiàn)】

[1]趙佳威,陸澳,趙洋等.血清蛋白質(zhì)組高豐度蛋白去除方法比較研究[J/OL].質(zhì)譜學(xué)報:1-12[2024-03-20].http://kns.cnki.net/kcms/detail/11.2979.TH.20240318.1717.003.html.

[2]Wang J, Xie W, Sun L, et al. Establishment and clinical application evaluations of a deep mining strategy of plasma proteomics based on nanomaterial protein coronas. Anal Chim Acta. 2023;1275:341569. doi:10.1016/j.aca.2023.341569