2023年8月,青蓮百奧CTO趙焱博士與中國(guó)人民解放軍總 醫(yī)院合作的血漿蛋白質(zhì)組最新成果發(fā)表于《Analytica Chimica Acta》。該研究利用DMB磁珠富集47例臨床血漿 低豐度蛋白質(zhì)。通過(guò)血漿蛋白質(zhì)組鑒定出18種與神經(jīng)系 統(tǒng)疾病相關(guān)或腦組織特異性表達(dá)的差異蛋白,并交叉驗(yàn)證 了ENPP2和SLC2A1/Glut1蛋白的ELISA結(jié)果,證明了臨 床生物標(biāo)志物研究的可行性。
設(shè)計(jì)了一系列實(shí)驗(yàn)來(lái)評(píng)估該策略的有效性:
DMB磁珠富集與傳統(tǒng)富集方法的定性深度和重現(xiàn)性比較:高豐度蛋白去除(2種和14種)、六肽配體富集和DMB磁珠富集處理,比較定量結(jié)果;
血漿和DMB磁珠不同孵育時(shí)間和消化方法的比較:不同時(shí)間(0.5、1、2和4小時(shí))孵育,比較定量結(jié)果
不同血漿加入體積富集結(jié)果比較:不同體積的血漿樣品加入等體積的DMB磁珠中進(jìn)行富集,比較定量結(jié)果
定量結(jié)果可靠性評(píng)價(jià):向等量的血漿中添加不同梯度的大腸桿菌蛋白混合物,檢測(cè)大腸桿菌蛋白和血漿蛋白
采用該策略分析了來(lái)自MSA組和健康對(duì)照組(MSA患者n=18;健康對(duì)照n = 18)的血漿樣本。
該研究的血漿深度挖掘策略提高了血漿蛋白質(zhì)組的檢測(cè)深度,同時(shí)在樣品富集方面具有良好的穩(wěn)定性,同時(shí)在節(jié)省時(shí)間和減少損失方面具有一定優(yōu)勢(shì)。將該策略應(yīng)用于MSA疾病標(biāo)志物發(fā)現(xiàn)中,鑒定出18種與神經(jīng)系統(tǒng)疾病相關(guān)或腦組織特異性表達(dá)的差異蛋白,并交叉驗(yàn)證了ENPP2和SLC2A1/Glut1蛋白的ELISA結(jié)果,證明了臨床生物標(biāo)志物研究的可行性。
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