2024年3月29日，第二屆TICSSO國際單細(xì)胞及空間組學(xué)大會在深圳光明云谷國際會議中心隆重召開，北京青蓮百奧生物科技有限公司受邀參會并推出了全息空間蛋白質(zhì)組學(xué)解決方案。該解決方案的發(fā)布標(biāo)志著非特征驅(qū)動的采樣策略正式應(yīng)用于實踐，推動了蛋白質(zhì)組學(xué)領(lǐng)域的技術(shù)進(jìn)步和創(chuàng)新。通過全面分析蛋白質(zhì)組，科學(xué)家們有望促進(jìn)生物醫(yī)藥領(lǐng)域的研究和開發(fā)，為新藥發(fā)現(xiàn)、疾病診斷和治療等方面帶來更深入的理解和更有效的解決方案，是蛋白質(zhì)組學(xué)領(lǐng)域的一項重要里程碑。

青蓮百奧高級產(chǎn)品經(jīng)理楊辰女士向與會嘉賓詳細(xì)介紹了《全息空間蛋白質(zhì)組學(xué)完整解決方案》，她提出：青蓮百奧的空間蛋白質(zhì)組學(xué)整體解決方案融合了全面性、創(chuàng)新性、精準(zhǔn)性和深度解析的特點，正如庖丁解牛般。此次推出展示了青蓮百奧在科學(xué)研究和技術(shù)開發(fā)方面的強(qiáng)大實力，也是生命科學(xué)領(lǐng)域的重要創(chuàng)舉。

全息空間蛋白質(zhì)組學(xué)解決方案：全面創(chuàng)新、精準(zhǔn)解析如庖丁解牛

青蓮百奧的全息空間蛋白質(zhì)組學(xué)解決方案革新了空間蛋白質(zhì)組學(xué)。研發(fā)團(tuán)隊使用人皮膚血管瘤石蠟樣本，結(jié)合先進(jìn)儀器，包括 MMI CellCut Plus LCM 激光捕獲顯微切割儀、微量/通用型蛋白質(zhì)組試劑盒和自動化前處理機(jī)器人，進(jìn)行一站式操作。團(tuán)隊對樣本進(jìn)行烤片、脫蠟、復(fù)水、HE 染色等步驟，然后成像并選擇目標(biāo)區(qū)域進(jìn)行切割取樣。酶解后，使用 timsTOF HT 高性能質(zhì)譜平臺進(jìn)行蛋白質(zhì)組學(xué)檢測，生成與組織微環(huán)境圖像相匹配的全覆蓋空間蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)。

全息空間蛋白質(zhì)組學(xué)生信分析

面對全息空間蛋白質(zhì)組學(xué)產(chǎn)生的海量數(shù)據(jù)，如何有效地利用生物信息學(xué)分析手段進(jìn)行挖掘和展示成為眾多研究者的焦點。為此，青蓮百奧生物信息學(xué)團(tuán)隊結(jié)合前沿文獻(xiàn)的經(jīng)驗，專門針對全息空間蛋白質(zhì)組學(xué)開發(fā)了一系列工具，旨在實現(xiàn)數(shù)據(jù)的可視化、深度挖掘以及高質(zhì)量的展示。

全息空間蛋白質(zhì)組學(xué)實測數(shù)據(jù)

高深度檢測

我們通過對目標(biāo)區(qū)域進(jìn)行全面檢測，獲得了25份蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)，這些數(shù)據(jù)含有空間位置信息。每份數(shù)據(jù)都對應(yīng)于精細(xì)組織，完整構(gòu)建了“全息”的空間蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)集。這些數(shù)據(jù)集平均每個樣本可檢測到4000多個蛋白質(zhì)，揭示了蛋白質(zhì)豐度與空間定位之間的相關(guān)性。

精準(zhǔn)空間聚類分析

在人皮膚血管瘤中，通過對25個區(qū)域的蛋白表達(dá)及空間信息進(jìn)行聚類分析，成功將其劃分為3組。組間差異分析揭示出差異蛋白，其中已知的潛在治療靶點CD30與現(xiàn)有研究結(jié)果一致。這一結(jié)果突顯了全息空間蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)的有效性。

精準(zhǔn)差異蛋白展示與富集分析

針對聚類得到的不同組進(jìn)行差異蛋白表達(dá)水平展示，并對各組進(jìn)行富集分析。GSEA分析揭示了與血管瘤相關(guān)的上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化和紫外線應(yīng)激通路的富集，展示了全息空間的有效性。

其他實測數(shù)據(jù)展示

在研發(fā)過程中，研發(fā)團(tuán)隊積累了豐富的樣本經(jīng)驗，涵蓋人食管、小鼠大腦、腎、胰腺、卵巢、乳腺、十二指腸、腹膜和兔子皮膚等多個樣本類型。研發(fā)團(tuán)隊還對不同區(qū)域大小與檢測深度的關(guān)系進(jìn)行了測試，并利用這些實驗結(jié)果指導(dǎo)了后續(xù)的實驗優(yōu)化工作。

青蓮百奧空間蛋白質(zhì)組學(xué)整體性解決方案特點

送樣指南

青蓮百奧已成功打造了一個集區(qū)域空間蛋白質(zhì)組學(xué)和全息空間蛋白質(zhì)組學(xué)于一體的綜合平臺，實現(xiàn)了個性化圈選不規(guī)則點位的蛋白質(zhì)組精準(zhǔn)檢測以及對組織微環(huán)境進(jìn)行高分辨率全覆蓋式蛋白質(zhì)組精準(zhǔn)檢測的功能。這個平臺滿足了蛋白質(zhì)組研究的多重需求，為空間蛋白質(zhì)組學(xué)領(lǐng)域提供了更多選擇。

總結(jié)

空間蛋白質(zhì)組學(xué)蓬勃發(fā)展，正迎頭趕上并超越空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)?？臻g維度功能的解析對精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)至關(guān)重要。作為空間蛋白為主導(dǎo)的空間多組學(xué)，將引領(lǐng)下一代“精準(zhǔn)蛋白基因組學(xué)”。青蓮百奧作為空間蛋白質(zhì)組學(xué)的先鋒，致力于推進(jìn)該領(lǐng)域技術(shù)進(jìn)步，為前沿研究提供支持和引領(lǐng)。