深度洞察藥物、小分子、多肽、核酸及蛋白與蛋白質(zhì)相互作用的結(jié)構(gòu)變化，蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的“X光片”
當(dāng)?shù)鞍讟?gòu)象發(fā)生變化時(shí)（例如與小分子結(jié)合），會(huì)暴露出不同的廣譜性蛋白酶酶切位點(diǎn)。
一次酶切后再將蛋白樣品變性，用胰酶進(jìn)行二次酶切。
通過(guò)質(zhì)譜檢測(cè)，比較不同處理?xiàng)l件的樣品中，全酶切及半酶切肽段（LiP酶切）的信號(hào)強(qiáng)度變化，可以分析蛋白構(gòu)象變化。
通過(guò)分析差異肽段的情況可以確定小分子與蛋白結(jié)合的區(qū)域。
發(fā)現(xiàn)蛋白質(zhì)/小分子(代謝物和DNA等)與蛋白質(zhì)相互作用導(dǎo)致的結(jié)構(gòu)變化,明確蛋白質(zhì)/小分子(代謝物和DNA等)介導(dǎo)的酶、轉(zhuǎn)錄因子和轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白等一系列調(diào)控過(guò)程如何使細(xì)胞進(jìn)行正常的生命活動(dòng)。
通過(guò)檢測(cè)藥物結(jié)合靶蛋白導(dǎo)致的構(gòu)象變化明確藥物靶點(diǎn),解析藥物發(fā)揮作用的機(jī)制,利于疾病的治療及藥物的研發(fā)。
結(jié)構(gòu)影響蛋白質(zhì)功能，全局分析結(jié)構(gòu)蛋白質(zhì)組以判斷是否反映病理變化并產(chǎn)生新型疾病生物標(biāo)志物。
從蛋白結(jié)構(gòu)層面解析蛋白功能狀態(tài)的改變,研究腫瘤和疾病患者蛋白質(zhì)組結(jié)構(gòu)上的不同,深入研究癌癥和疾病的發(fā)生、發(fā)展機(jī)理。
根據(jù)原始數(shù)據(jù)，提供結(jié)構(gòu)差異蛋白和豐度差異蛋白兩個(gè)維度的信息，同時(shí)提供結(jié)構(gòu)和豐度聯(lián)合分析的結(jié)果。每個(gè)模塊提供差異蛋白篩選、蛋白功能富集和分析及相互作用分析，結(jié)構(gòu)差異蛋白還提供結(jié)構(gòu)變化蛋白的二維碼圖和3D結(jié)構(gòu)圖。
| 實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì) | 豐度變化 | 結(jié)構(gòu)變化 | 聯(lián)合分析 | 二維碼圖 | 3D圖 |
| 有胰酶對(duì)照（TrP組） | √ | √ | √ | √ | √ |
| 無(wú)胰酶對(duì)照（TrP組） | × | √ | × | √ | √ |
標(biāo)準(zhǔn)版服務(wù)（同時(shí)進(jìn)行（PK酶+TrP酶）和（TrP酶）酶切）能夠提供更全面的信息（豐度+結(jié)構(gòu)），經(jīng)濟(jì)版（只進(jìn)行（PK酶+TrP酶）酶切）適用于更關(guān)注蛋白結(jié)構(gòu)的研究需求（結(jié)構(gòu)）
服務(wù)類型 | 服務(wù)內(nèi)容 |
| 標(biāo)準(zhǔn)版 | 1、每個(gè)樣本2種酶切方法：1）蛋白酶K+TrP酶；2）TrP酶 2、每個(gè)樣本2次質(zhì)譜檢測(cè) 3、結(jié)構(gòu)肽段的豐度校正 4、差異豐度蛋白分析 5、差異結(jié)構(gòu)蛋白分析 6、差異豐度和結(jié)構(gòu)蛋白聯(lián)合分析 |
| 經(jīng)濟(jì)版 | 1、每個(gè)樣本1種酶切方法：蛋白酶K+TrP酶 2、每個(gè)樣本1次質(zhì)譜檢測(cè) 3、差異結(jié)構(gòu)蛋白分析 |
| 內(nèi)容 | 常規(guī)報(bào)告 | 藥物靶點(diǎn)報(bào)告 |
| 豐度信息 | √ | √ |
| 豐度數(shù)據(jù) | √ | √ |
| 結(jié)構(gòu)信息 | √ | √ |
| 結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù) | √ | √ |
豐度分析 | √ | × |
結(jié)構(gòu)分析 | √ | √ |
聯(lián)合分析 | √ | × |
數(shù)據(jù)庫(kù)注釋 | × | √ |
| 二維碼圖 | √ | √ |
差異肽段的酶切情況 | × | √ |
3D圖 | √ | √ |
發(fā)表期刊：Nature structural & molecular biology
影響因子：12.5
發(fā)表單位：蘇黎世聯(lián)邦理工學(xué)院
發(fā)表時(shí)間：2024.07.29
| 樣本類型 | 送樣量要求/樣本 | 運(yùn)輸 | |
| 動(dòng)物組織 | 10 mg | 干冰運(yùn)輸 | |
| 植物組織 | 柔軟組織 （木本植物的葉、花等，草本植物，藻類，蕨類植物） | 400 mg | |
堅(jiān)硬組織 （根、樹(shù)皮、樹(shù)枝，果實(shí)種子等） | 4 g | ||
| 細(xì)胞 | 2*106 | ||
| 蛋白質(zhì)溶液（非變性裂解液） | 1 μg/μL(不低于200 μL) | ||
| 血清 | 100 μL | ||
| 腦脊液 | 200 μL | ||
?可以同時(shí)分析豐度，對(duì)結(jié)構(gòu)信息進(jìn)行補(bǔ)充
?可以利用豐度信息對(duì)結(jié)構(gòu)肽段進(jìn)行校正，增加數(shù)據(jù)可信度
利用高通量質(zhì)譜技術(shù)全局分析蛋白質(zhì)發(fā)生相互作用時(shí)的熱穩(wěn)定性變化
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