4D定量蛋白質(zhì)組學(xué)基于timsTOF質(zhì)譜檢測平臺,在傳統(tǒng)3D蛋白質(zhì)組學(xué)的保留時間(retention time)、質(zhì)荷比(m/z)和離子強(qiáng)度(intensity)三個維度的分離基礎(chǔ)上,增加了肽段的碰撞截面積(collision cross-section),即離子淌度(ion mobility)的分離,從而降低樣本復(fù)雜度,大幅提高掃描速度和檢測靈敏度,帶來蛋白質(zhì)組學(xué)在鑒定深度、檢測周期、定量準(zhǔn)確性等性能上的革命性提升。
先進(jìn)的儀器平臺
國內(nèi)首裝timsTOF HT質(zhì)譜儀
卓越穩(wěn)定性保證大隊(duì)列數(shù)據(jù)產(chǎn)出
同一樣本三次重復(fù)相關(guān)性高達(dá)99%,CV值低于5%,數(shù)據(jù)產(chǎn)出穩(wěn)定
超快掃描速度和超高分辨率
采用全新的第四代TIMS-XR和更先進(jìn)的數(shù)字轉(zhuǎn)換技術(shù),實(shí)現(xiàn)更高的鑒定深度
超寬濃度范圍檢測能力
上樣范圍從pg到μg,適合外泌體、FFPE石蠟切片、活檢穿刺組織等臨床微量樣本廣泛適用
臨床大隊(duì)列樣本的疾病分型、生物標(biāo)志物發(fā)現(xiàn);生理、病理及感染免疫的機(jī)制研究;藥物的研發(fā)與藥效評估
動植物的生長發(fā)育、遺傳育種及生態(tài)保護(hù)研究;生物對環(huán)境的適應(yīng)及脅迫抗逆的機(jī)制研究;營養(yǎng)與飼料成分的分析與優(yōu)化
食品營養(yǎng)價值與品質(zhì)的分析鑒定;產(chǎn)品成分的分析與優(yōu)化;食品安全的提升
項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)涵蓋多物種、多組織器官類型及多疾病類型,包括:
100+種人類器官、組織、細(xì)胞及疾病類型;
60+種小鼠器官、組織、細(xì)胞及疾病類型;
60+種醫(yī)學(xué)、農(nóng)牧領(lǐng)域模式動物及非常見動物樣本;
60+種藥物、農(nóng)牧領(lǐng)域模式植物及非常見植物樣本;
60+種細(xì)菌、真菌等微生物樣本。
與100+所醫(yī)院、研究所等單位建立深度合作;
合作文章累積影響因子300+,發(fā)表于多部醫(yī)學(xué)、生物學(xué)、植物等領(lǐng)域期刊。
提供timsTOF HT、timsTOF Pro2、Orbitrap Astral、Orbitrap Exploris? 480、Q Exactive HF-X、Orbitrap Eclipse等多種質(zhì)譜平臺選擇;
提供DIA、dDIA、LFQ、TMT等多種定量方法選擇。
發(fā)表期刊:Oxidative Medicine and Cellular Longevity
影響因子:7.3
發(fā)表單位:首都醫(yī)科大學(xué)中醫(yī)藥學(xué)院
發(fā)表時間:2022.03.18
樣本類型 | 送樣量 | |
動物組織 | 常規(guī)組織(腦、心、肝、脾、肺、腎、肌肉等柔軟組織) | 10 mg |
堅(jiān)硬組織(軟骨、毛發(fā)) | 100 mg | |
植物組織 | 柔軟組織(木本植物的葉、花等,草本植物,藻類,蕨類植物) | 200 mg |
堅(jiān)硬組織(根、樹皮、樹枝,果實(shí)種子等) | 2 g | |
微生物 | 常見細(xì)菌、真菌菌體(菌體沉淀)、精細(xì)胞 | 30 μL |
細(xì)胞 | 懸浮/貼壁培養(yǎng)細(xì)胞(細(xì)胞計(jì)數(shù)/沉淀) | 2×106或20 μL |
液體類 | 血漿/血清(不去除高豐度) | 5 μL |
血漿/血清(去除高豐度-伯樂) | 100 μL | |
血漿/血清(去除高豐度-TOP2/TOP14) | 50 μL | |
血漿/血清(去除高豐度-DMB蛋白冠) | 50 μL | |
腦脊液(不去除高豐度) | 100 μL | |
腦脊液(去除高豐度-TOP2/TOP14) | 300 μL | |
卵泡液(不去高豐度) | 100 μL | |
卵泡液(去除高豐度-伯樂)、尿液,精液 | 1 mL | |
淋巴液、關(guān)節(jié)液、穿刺液、腹水 | 3 mL | |
唾液/淚液/乳汁 | 500 μL | |
培養(yǎng)基上清(不能使用含血清的培養(yǎng)基) | 5 mL | |
FFPE | 每片厚度10 μm,面積1.5×2 cm | 2-5片 |
其他 | 蛋白溶液(最佳Buffer是8M Urea) | 10 μg |
4D-蛋白質(zhì)組學(xué)是在3D分離即保留時間(retention time)、質(zhì)荷比(m/z)、離子強(qiáng)度(intensity)這三個維度的基礎(chǔ)之上增加了第四個維度——離子淌度(mobility)的分離。正向氣流攜帶離子進(jìn)入逆向梯度電場(電場逐級增大),若氣流速度與離子的遷移速率相等則離子相對于漂移管靜止,即不同離子依其淌度差異,分布在不同電場強(qiáng)度的位置。離子截面越大,離子淌度越小,維持靜止所需的電場強(qiáng)度越高,即穩(wěn)定在高場區(qū)域。此時若逐漸降低電壓,即實(shí)現(xiàn)掃描。
當(dāng)物質(zhì)的性質(zhì)相似在色譜中共洗脫,或具備相同的質(zhì)荷比在質(zhì)譜中為同一簇離子,會導(dǎo)致色譜或質(zhì)譜無法有效分離,很難達(dá)到更好的檢測效果。離子淌度分離的增加解決了這一問題,對異構(gòu)體有更大的區(qū)分能力。
@2024北京青蓮百奧生物科技有限公司 京ICP備17052224號