針對(duì)血液中攜帶的蛋白質(zhì)信息進(jìn)行挖掘能夠?yàn)榧膊≡缭\、疾病機(jī)制理解、治療靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)及個(gè)性化醫(yī)療等方面提供重要見解。新學(xué)期已經(jīng)到來，讓我們快速進(jìn)入學(xué)習(xí)狀態(tài)，看看過去的一個(gè)月研究者們利用血漿蛋白組發(fā)表了哪些成果，獲取科研靈感吧~
8月8日，英國(guó)牛津大學(xué)納菲爾德人口健康系研究團(tuán)隊(duì)使用英國(guó)生物樣本庫血漿蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)（n=45441），利用鑒定到的2897種血漿蛋白，通過LightGBM等機(jī)器學(xué)習(xí)模型開發(fā)了基于204種蛋白質(zhì)的年齡預(yù)測(cè)模型與基于20種蛋白質(zhì)的簡(jiǎn)化版，并在中國(guó)慢性病前瞻性研究隊(duì)列（n=3977）和芬蘭隊(duì)列（n=1990）中進(jìn)行了驗(yàn)證?；诘鞍踪|(zhì)組的衰老評(píng)分與18種主要慢性疾病的發(fā)生、多疾病共同發(fā)生及全因死亡風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)，相關(guān)通路包括細(xì)胞外基質(zhì)相互作用、免疫反應(yīng)和炎癥、激素調(diào)節(jié)和生殖、神經(jīng)元結(jié)構(gòu)和功能以及發(fā)育和分化等。
8月12日，比利時(shí)列日大學(xué)GIGA研究所團(tuán)隊(duì)通過兩個(gè)隊(duì)列STORI（n=115）和SPARE（n=211）的血清蛋白質(zhì)組分析，利用單因素Cox比例風(fēng)險(xiǎn)模型評(píng)估克羅恩病患者停用英夫利昔單抗后的復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn)，發(fā)現(xiàn)與短期復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn)（≤6個(gè)月）和中期/長(zhǎng)期復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn)（>6個(gè)月）相關(guān)的不同血清蛋白譜，排名前10的生物標(biāo)志物均表現(xiàn)出優(yōu)于以往標(biāo)志物及模型的預(yù)測(cè)能力，顯示出指導(dǎo)英夫利西單抗停藥的潛力。
8月17日，美國(guó)明尼蘇達(dá)州梅奧診所團(tuán)隊(duì)通過全面分析30例巨細(xì)胞動(dòng)脈炎患者來源的疾病活動(dòng)期與非活動(dòng)期血漿樣本和對(duì)照者的血漿樣本蛋白質(zhì)組，鑒定出活性巨細(xì)胞動(dòng)脈炎和對(duì)照組之間差異蛋白質(zhì)537個(gè)，非活性巨細(xì)胞動(dòng)脈炎和對(duì)照組之間差異蛋白質(zhì)781個(gè)，差異蛋白提示不同的免疫反應(yīng)，代謝途徑和潛在的新的生理過程涉及每種疾病狀態(tài)。在活動(dòng)期巨細(xì)胞動(dòng)脈炎患者中發(fā)現(xiàn)了16種與疾病活動(dòng)度相關(guān)的蛋白，構(gòu)建隨機(jī)森林模型準(zhǔn)確地區(qū)分了活性和非活性巨細(xì)胞動(dòng)脈炎組與對(duì)照組。
8月21日，冰島心臟協(xié)會(huì)團(tuán)隊(duì)使用血清蛋白質(zhì)組學(xué)，在5127名冰島老年人的前瞻性人群年齡，基因/環(huán)境易感性-雷克雅未克研究（AGES）隊(duì)列中，在中位隨訪12.8年期間發(fā)現(xiàn)了303種與遲發(fā)性阿爾茨海默病事件相關(guān)的蛋白質(zhì)。超過40%的這些蛋白獨(dú)立于APOE-ε4載體狀態(tài)與遲發(fā)性阿爾茨海默病相關(guān)，與神經(jīng)元過程有關(guān)，并與腦和腦脊液中的遲發(fā)性阿爾茨海默病蛋白特征重疊。17種與遲發(fā)性阿爾茨海默病相關(guān)的蛋白強(qiáng)烈依賴于APOE-ε4載體狀態(tài)，與腦脊液的關(guān)聯(lián)基本一致，其中TBCA, ARL2, S100A13和IRF6被APOE-ε4下調(diào)，但由于遲發(fā)性阿爾茨海默病而上調(diào)，這一發(fā)現(xiàn)在外部隊(duì)列中得到了驗(yàn)證。
8月14日，美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院老年研究所團(tuán)隊(duì)使用巴爾的摩縱向衰老研究、英國(guó)生物樣本庫數(shù)據(jù)并對(duì)巴爾的摩縱向衰老研究隊(duì)列進(jìn)行了血漿蛋白質(zhì)組檢測(cè)，發(fā)現(xiàn)流感、病毒、呼吸道、皮膚和皮下感染與長(zhǎng)期癡呆風(fēng)險(xiǎn)增加、以顳葉為代表的特定區(qū)域腦容量減少相關(guān)。在有感染史的患者血漿中，942個(gè)免疫相關(guān)蛋白中有260個(gè)存在差異表達(dá)。在感染相關(guān)蛋白中，35預(yù)測(cè)了易發(fā)生感染特異性萎縮的腦區(qū)體積變化。其中一些蛋白，包括PIK3CG, PACSIN2和PRKCB，與認(rèn)知功能下降和癡呆的血漿生物標(biāo)志物相關(guān)。影響免疫相關(guān)感染相關(guān)蛋白ITGB6和TLR5表達(dá)的遺傳變異體可預(yù)測(cè)腦容量丟失。
8月19日，四川大學(xué)華西醫(yī)院團(tuán)隊(duì)聚焦碎片化睡眠對(duì)葡萄糖代謝穩(wěn)態(tài)和認(rèn)知功能的影響，使用小鼠睡眠剝奪儀對(duì)小鼠進(jìn)行間歇性觸覺刺激，建立慢性碎片化睡眠模型，使用血漿蛋白質(zhì)組分析碎片化睡眠小鼠血漿蛋白質(zhì)變化，發(fā)現(xiàn)碎片化睡眠破壞了小鼠的葡萄糖代謝。該研究聯(lián)合代謝組學(xué)與機(jī)制實(shí)驗(yàn)，首次揭示了乙酸在碎片化睡眠中維持糖代謝穩(wěn)態(tài)和認(rèn)知功能的重要作用，系統(tǒng)性解析了乙酸通過激活丙酮酸羧化酶，促進(jìn)下丘腦星形膠質(zhì)細(xì)胞糖酵解和TCA循環(huán)，調(diào)控葡萄糖代謝，從而維持SF中代謝穩(wěn)態(tài)和認(rèn)知功能。
8月29日，蘇黎世大學(xué)醫(yī)院團(tuán)隊(duì)聚焦免疫檢查點(diǎn)抑制劑治療相關(guān)免疫相關(guān)不良事件，通過血清蛋白質(zhì)組學(xué)分析、多重細(xì)胞因子和趨化因子分析、流式細(xì)胞術(shù)等方法，闡明免疫相關(guān)不良事件發(fā)生時(shí)T細(xì)胞活性異常，I型和III型免疫標(biāo)簽表達(dá)改變，外周血中表達(dá)IL-17A的CD4 T細(xì)胞比例增加。該結(jié)果在免疫治療誘導(dǎo)的皮疹和結(jié)腸炎樣本的多重免疫組織化學(xué)和空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析中得到驗(yàn)證。對(duì)2例出現(xiàn)輕度心肌炎、結(jié)腸炎和皮疹的患者給予抗IL-17A治療，不良反應(yīng)消失。
8月29日，英國(guó)愛丁堡大學(xué)心血管科學(xué)中心團(tuán)隊(duì)聚焦增強(qiáng)產(chǎn)熱棕色脂肪組織功能這一治療代謝性疾病的策略，證明了氧感受器PHD2基因的選擇性脂肪細(xì)胞缺乏克服了產(chǎn)熱棕色脂肪組織在熱中性狀態(tài)下的休眠。PHD2缺乏導(dǎo)致HIF2穩(wěn)定并與Ucp1啟動(dòng)子結(jié)合，從而增強(qiáng)其在棕色脂肪細(xì)胞中的表達(dá)。對(duì)年齡、基因和環(huán)境研究中5457名參與者的血清蛋白質(zhì)組學(xué)分析揭示了血清PHD2與代謝疾病風(fēng)險(xiǎn)增加相關(guān)。
8月17日，美國(guó)波士頓大學(xué)Chobanian & Avedisian醫(yī)學(xué)院團(tuán)隊(duì)通過對(duì)434例腎臟疾病患者的血漿樣本進(jìn)行了血漿蛋白質(zhì)組分析，發(fā)現(xiàn)156種血漿蛋白質(zhì)與急性腎小管損傷顯著關(guān)聯(lián)，其中骨橋蛋白、巨噬細(xì)胞甘露糖受體1和粘連蛋白C等生物標(biāo)志物表現(xiàn)出了最強(qiáng)的關(guān)聯(lián)性，并識(shí)別出了一系列與急性腎小管損傷嚴(yán)重程度密切相關(guān)的血漿生物標(biāo)志物。結(jié)合區(qū)域轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、單細(xì)胞RNA測(cè)序等手段，發(fā)現(xiàn)急性腎小管損傷的發(fā)病機(jī)制與免疫調(diào)節(jié)和細(xì)胞器應(yīng)激反應(yīng)等生物學(xué)過程密切相關(guān)。在腎臟精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)項(xiàng)目（n=44）、社區(qū)動(dòng)脈粥樣硬化風(fēng)險(xiǎn)研究（n=4610）以及COVID-19宿主響應(yīng)與臨床結(jié)果研究（n=268）隊(duì)列中驗(yàn)證了急性腎損傷相關(guān)的急性腎小管損傷生物標(biāo)志物。
通過對(duì)以上前沿文章的學(xué)習(xí)，想必大家對(duì)血漿蛋白質(zhì)組的研究思路和研究方法有了更深刻的認(rèn)知。不難看出，血液作為最易獲得的臨床微創(chuàng)樣本，在疾病診療標(biāo)志物發(fā)現(xiàn)中起到了重大作用。青蓮百奧針對(duì)血漿蛋白質(zhì)組研究標(biāo)志物篩選、風(fēng)險(xiǎn)預(yù)測(cè)、患者分型分析需求，獨(dú)家推出疾病標(biāo)志物篩選、預(yù)后標(biāo)志物篩選、分子分型高級(jí)分析報(bào)告，助大家在科研的海洋中乘風(fēng)破浪。
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