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中藥現(xiàn)代化:蛋白質(zhì)組學(xué)在中藥作用機制研究中的應(yīng)用

歷經(jīng)千年的傳承,中藥的有效性、實用性和科學(xué)性已毋庸置疑,但是其多成分、多靶點、多層次的作用特點給作用機制的研究帶來困難,阻礙了中藥的現(xiàn)代化和國際化進程。蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)是從整體的角度分析細胞內(nèi)動態(tài)變化的蛋白質(zhì)的組成與活動規(guī)律,與中藥的“整體觀”和“動態(tài)觀”不謀而合,為闡明中藥作用機制帶來了曙光。

近年,蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)在中藥作用機制和藥物靶點研究(>>>中藥靶點研究攻略:一文精通中藥靶點研究思路)中的應(yīng)用取得了實質(zhì)性的進展。本期,我們將探討蛋白質(zhì)組學(xué)如何助力中藥研究,深入理解其在中藥作用機制中的關(guān)鍵角色。讓我們一探究竟,掌握中藥作用機制研究的新思路!

 

TMT定量蛋白質(zhì)組學(xué)揭示小青龍湯對中性粒細胞性哮喘的保護作用

2024年8月,廣州中醫(yī)藥大學(xué)第一附屬醫(yī)院黃秀芳團隊在期刊J Ethnopharmacol (IF=4.8)上發(fā)表了題為“Integrative analysis of network pharmacology and proteomics reveal the protective effect of Xiaoqinglong Decotion on neutrophilic asthma”的研究論文,該研究以中性粒細胞性哮喘組小鼠為研究對象,平行設(shè)置對照組、地塞米松治療組、低/中/高劑量小青龍湯(XQLD)治療組,利用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)、TMT定量蛋白質(zhì)組學(xué)和動物實驗等發(fā)現(xiàn)XQLD通過抑制鐵死亡途徑和ARG1、MMP12、SPP1表達,以及激活Rap1信號通路,有效改善了嗜中性粒細胞性哮喘小鼠的氣道炎癥。

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TMT定量蛋白質(zhì)組學(xué)揭示小青龍湯對中性粒細胞性哮喘的保護作用[1]


TMT定量蛋白質(zhì)組學(xué)揭示土茯苓治療高血壓的分子機制

2024年5月,貴州中醫(yī)藥大學(xué)錢海兵團隊在期刊Front Pharmacol (IF= 4.4)上發(fā)表了題為“Investigation of the molecular mechanism of Smilax glabra Roxb. in treating hypertension based on proteomics and bioinformatics”的研究論文,該研究以高血壓大鼠為研究對象,平行設(shè)置對照組、模型組、陰性對照組和低/中/高劑量土茯苓(SGR)治療組,利用TMT定量蛋白質(zhì)組學(xué)、藥物成分鑒定、蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用(PPI)網(wǎng)絡(luò)分析和分子對接發(fā)現(xiàn)SGR通過調(diào)節(jié)ALDH2等核心靶標,可能影響多種免疫細胞的浸潤,從而對高血壓產(chǎn)生治療作用。

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TMT定量蛋白質(zhì)組學(xué)揭示土茯苓治療高血壓的分子機制[2]


TMT定量蛋白質(zhì)組學(xué)揭示人參皂苷Re抗心肌缺血的潛在靶標

2024年5月,福建醫(yī)科大學(xué)李少光團隊在期刊Phytomedicine (IF=6.7)上發(fā)表了題為“Integration of network pharmacology and proteomics analysis to identify key target pathways of Ginsenoside Re for myocardial ischemia”的研究論文,該研究以心肌缺血小鼠為研究對象,平行設(shè)置對照組、模型組和人參皂苷(Re)治療組,利用藥效學(xué)研究、網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)、分子對接和TMT定量蛋白質(zhì)組學(xué)發(fā)現(xiàn)人參皂苷Re可能通過靶向MAPK、AKT、AMPK和鐵死亡途徑來預(yù)防和/或治療心肌缺血損傷,并保護心肌細胞免受氧化損傷。

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TMT定量蛋白質(zhì)組學(xué)揭示人參皂苷Re抗心肌缺血的潛在靶標[3]


TMT定量蛋白質(zhì)組學(xué)揭示消癭湯治療格雷夫斯病的機制

2024年5月,南京中醫(yī)藥大學(xué)附屬中西醫(yī)結(jié)合醫(yī)院朱粉霞團隊在期刊J Ethnopharmacol (IF= 4.8)上發(fā)表了題為“Investigating the mechanism and efficacy material basis of Xiehuo Xiaoying decoction for treating Graves' disease via thyroid cell apoptosis based on proteomics and molecular docking techniques”的研究論文,該研究以格雷夫斯?。℅D)小鼠為研究對象,平行設(shè)置模型組、低/高劑量消癭湯治療組和GPS(龍膽苦苷)治療組,利用藥效學(xué)研究、藥物成分鑒定、TMT定量蛋白質(zhì)組學(xué)和分子對接等發(fā)現(xiàn)GPS是XHXY治療GD的主要有效物質(zhì)基礎(chǔ),XHXY通過促進甲狀腺細胞凋亡發(fā)揮治療GD的療效,這一過程涉及到上調(diào)FADD、Caspase 8和Caspase 3的表達。

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TMT定量蛋白質(zhì)組學(xué)揭示消癭湯治療格雷夫斯病的機制[4]


4D定量蛋白質(zhì)組學(xué)揭示益氣除痰方抑制肺癌的機制

2024年1月,廣州中醫(yī)藥大學(xué)張曉君團隊在期刊J Ethnopharmacol (IF=4.8)上發(fā)表了題為“Yi Qi Chu Tan Formula (YQCTF) inhibited the progress of lung cancer via regulating tumor-associated neutrophil: An integrated study of network pharmacology, proteomics and pharmacodynamics”的研究論文,該研究以肺癌小鼠為研究對象,平行設(shè)置對照組以及益氣除痰方(YQCTF-AE)治療組,利用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)、藥物成分鑒定、藥效學(xué)研究和4D定量蛋白質(zhì)組學(xué)發(fā)現(xiàn)YQCTF抑制了小鼠NSCLC異種移植物的進展,抑制了促腫瘤的腫瘤相關(guān)中性粒細胞,并改善了腫瘤免疫微環(huán)境(TIME)。

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4D定量蛋白質(zhì)組學(xué)揭示益氣除痰方抑制肺癌的機制[5]


蛋白質(zhì)組學(xué)在中藥作用機制研究中的思路

中藥作用機制的研究是藥物開發(fā)和生命科學(xué)領(lǐng)域的熱點話題,對于中藥現(xiàn)代化至關(guān)重要。本文分享了中藥研究的新策略,強調(diào)了蛋白質(zhì)組學(xué)在其中的關(guān)鍵作用。通過比較中藥處理前后的蛋白質(zhì)組學(xué)變化,我們能夠發(fā)現(xiàn)潛在的治療靶點和信號通路,為中藥的現(xiàn)代化進程注入新動力。讓我們一起探索這一領(lǐng)域的最新進展,推動中藥研究向前發(fā)展!

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蛋白質(zhì)組學(xué)在中藥作用機制研究中的思路

【參考文獻】

[1] Liao G, Yan Q, Zhang M, et al. Integrative analysis of network pharmacology and proteomics reveal the protective effect of Xiaoqinglong Decotion on neutrophilic asthma [J]. Journal of Ethnopharmacology, 2024, 330.

[2] Yang X, Qian H, Yang C, et al. Investigation of the molecular mechanism of Smilax glabra Roxb. in treating hypertension based on proteomics and bioinformatics [J]. Frontiers in Pharmacology, 2024, 15.

[3] Cai J, Zhan Y, Huang K, et al. Integration of network pharmacology and proteomics analysis to identify key target pathways of Ginsenoside Re for myocardial ischemia [J]. Phytomedicine, 2024, 132.

[4] Xiang P, Li Q, Cui G, et al. Investigating the mechanism and efficacy material basis of Xiehuo Xiaoying decoction for treating Graves' disease via thyroid cell apoptosis based on proteomics and molecular docking techniques [J]. Journal of Ethnopharmacology, 2024, 324.

[5] Le-Xin C, Ming-Jun L, Chun-Qi X, et al. Yi Qi Chu Tan Formula (YQCTF) inhibited the progress of lung cancer via regulating tumor-associated neutrophil: An integrated study of network pharmacology, proteomics and pharmacodynamics [J]. Journal of Ethnopharmacology, 2024, 318.

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