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質(zhì)譜分析數(shù)據(jù)為尊,儀器熱度不是金標(biāo)準(zhǔn)!

現(xiàn)在,基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)已經(jīng)成為了生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域研究的中堅力量。然而,當(dāng)面對琳瑯滿目的質(zhì)譜平臺時,我們也常常會陷入選擇困難的境地。今天,就讓我們一起比較不同質(zhì)譜儀的實(shí)測數(shù)據(jù),解決這一困擾各位老師已久難題!

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首先來看看市面上有哪些常見的質(zhì)譜儀

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用于蛋白質(zhì)組學(xué)的商用質(zhì)譜儀開發(fā)時間表(2011年后)

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上表展示了近年市面上常見的質(zhì)譜儀的參數(shù)。質(zhì)譜檢測包含許多環(huán)節(jié),每個部件的優(yōu)化都能帶來相應(yīng)的提升,而諸如Bruker公司的timsTOF系列質(zhì)譜儀更是增加了離子淌度(ion mobility)分離單元,額外增加了一個維度的分離,從而用別樣的形式大大提升了質(zhì)譜檢測的分辨率。


那么這么多質(zhì)譜儀,蛋白質(zhì)組檢測應(yīng)該如何選擇?

如果一個個比較不同質(zhì)譜儀的參數(shù),未免令人眼花繚亂,而且由于不同類型質(zhì)譜儀的設(shè)計不同,單純比較參數(shù)獲得的結(jié)果是片面的。不過我們可以化繁為簡,用更加直觀的方式對不同質(zhì)譜儀進(jìn)行比較。 

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小鼠腦組織樣本不同質(zhì)譜儀常規(guī)時間梯度DIA鑒定數(shù)據(jù)

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人血漿樣本不同質(zhì)譜儀常規(guī)時間梯度DIA鑒定數(shù)據(jù)

以上數(shù)據(jù)比較了市面上常見質(zhì)譜儀在常見上機(jī)時長時的組織和血液樣本鑒定深度??梢钥吹皆贠rbitrap Astral風(fēng)靡的當(dāng)下,無論是七年前發(fā)布的Q Exactive HF-X還是兩年前發(fā)布的timsTOF HT依然表現(xiàn)出穩(wěn)定的發(fā)揮。而最新發(fā)布的Orbitrap Astral雖然能夠在8 min的短梯度中鑒定出相當(dāng)可觀的蛋白數(shù),但無論是與自身更長時間梯度,還是與其他儀器橫向?qū)Ρ龋烫荻葘?dǎo)致的鑒定深度不足問題依舊難以完全規(guī)避。

質(zhì)譜儀的選擇固然重要,但更重要的是如何利用儀器進(jìn)行深入的蛋白質(zhì)組學(xué)研究。綜合以上信息,我們可以得出結(jié)論:在蛋白質(zhì)組學(xué)檢測中,市面上多種質(zhì)譜儀在常規(guī)時間梯度都具有足夠的能力滿足科研需求,但熱度最高的Orbitrap Astral 8 min卻難以達(dá)到符合預(yù)期的深度。可見與多數(shù)其他領(lǐng)域類似,新儀器的熱度不應(yīng)成為牽著用戶鼻子走的繩索,適合自己的平臺與服務(wù)才更為關(guān)鍵。

青蓮百奧歷經(jīng)十載深耕,鑄就卓越蛋白質(zhì)組學(xué)檢測平臺,提供多種質(zhì)譜儀器及檢測方式以供選擇的同時,由專業(yè)團(tuán)隊搭配先進(jìn)穩(wěn)定的自動化儀器設(shè)備,確保樣本預(yù)處理、上機(jī)檢測、生物信息學(xué)分析全流程標(biāo)準(zhǔn)執(zhí)行,更獨(dú)家推出專利產(chǎn)品血漿低豐度蛋白富集磁珠試劑盒(MagicOmics DMB3000),助力不同物種血漿、腦脊液、尿液、細(xì)胞上清液等樣本中低豐度蛋白質(zhì)的深度檢測。步驟雖繁必不敢省人工,試劑雖貴必不敢減物力,青蓮百奧專業(yè)售前售后真正為您解決科研道路上的難題,助您在科研的海洋中乘風(fēng)破浪。

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