TMT?(Tandem Mass Tag?)是由Thermo Scientific公司研發(fā)的多肽體外標(biāo)記技術(shù),能夠采用2-18個(gè)穩(wěn)定同位素標(biāo)簽高效標(biāo)記來自不同樣本的蛋白質(zhì)酶解產(chǎn)生的肽段。將標(biāo)記的肽段混合進(jìn)行質(zhì)譜檢測(cè),在二級(jí)質(zhì)譜中肽段上的TMT標(biāo)簽會(huì)優(yōu)先碎裂產(chǎn)生具有不同質(zhì)荷比的報(bào)告離子信號(hào)峰,據(jù)此可以獲得同一肽段在不同樣本中的表達(dá)差異。
檢測(cè)通量
一次性檢測(cè)6-18個(gè)樣本,大隊(duì)列樣本需每批加入1-2個(gè)相同樣本作為內(nèi)參;
適用范圍
擅長(zhǎng)復(fù)雜樣本定量分析,不適用于不同組織器官類型樣本混合檢測(cè);
重復(fù)性好
所有樣本混合上機(jī),同時(shí)進(jìn)行質(zhì)譜檢測(cè);
缺失值少
為后續(xù)生物信息學(xué)分析提供豐富的數(shù)據(jù);
注意事項(xiàng)
具有比值壓縮效應(yīng),蛋白質(zhì)差異倍數(shù)有一定程度壓縮。
臨床大隊(duì)列樣本的疾病分型、生物標(biāo)志物發(fā)現(xiàn);生理、病理及感染免疫的機(jī)制研究;藥物的研發(fā)與藥效評(píng)估
動(dòng)植物的生長(zhǎng)發(fā)育、遺傳育種及生態(tài)保護(hù)研究;生物對(duì)環(huán)境的適應(yīng)及脅迫抗逆的機(jī)制研究;營(yíng)養(yǎng)與飼料成分的分析與優(yōu)化
食品營(yíng)養(yǎng)價(jià)值與品質(zhì)的分析鑒定;產(chǎn)品成分的分析與優(yōu)化;食品安全的提升
提供timsTOF HT、timsTOF Pro2、Orbitrap Astral、Orbitrap Exploris? 480、Q Exactive HF-X、Orbitrap Eclipse等多種質(zhì)譜平臺(tái)選擇;
提供DIA、dDIA、LFQ、TMT等多種定量方法選擇。
項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)涵蓋多物種、多組織器官類型及多疾病類型,包括:
100+種人類器官、組織、細(xì)胞及疾病類型;
60+種小鼠器官、組織、細(xì)胞及疾病類型;
60+種醫(yī)學(xué)、農(nóng)牧領(lǐng)域模式動(dòng)物及非常見動(dòng)物樣本;
60+種藥物、農(nóng)牧領(lǐng)域模式植物及非常見植物樣本;
60+種細(xì)菌、真菌等微生物樣本。
與100+所醫(yī)院、研究所等單位建立深度合作;
合作文章累積影響因子300+,發(fā)表于多部醫(yī)學(xué)、生物學(xué)、植物等領(lǐng)域期刊。
發(fā)表期刊:Molecular Plant
影響因子:17.1
發(fā)表單位:中國(guó)科學(xué)院昆明植物研究所
發(fā)表時(shí)間:2019.12.05
樣本類型 | 送樣量 | |
動(dòng)物組織 | 常規(guī)組織(腦、心、肝、脾、肺、腎、肌肉等柔軟組織) | 20 mg |
堅(jiān)硬組織(軟骨、毛發(fā)) | 200 mg | |
植物組織 | 柔軟組織(木本植物的葉、花等,草本植物,藻類,蕨類植物) | 300 mg |
堅(jiān)硬組織(根、樹皮、樹枝,果實(shí)種子等) | 3 g | |
微生物 | 常見細(xì)菌、真菌菌體(菌體沉淀)、精細(xì)胞 | 50 μL |
細(xì)胞 | 懸浮/貼壁培養(yǎng)細(xì)胞(細(xì)胞計(jì)數(shù)/沉淀) | 5×106或20 μL |
液體類 | 血漿/血清(不去除高豐度) | 10 μL |
血漿/血清(去除高豐度-伯樂) | 300 μL | |
血漿/血清(去除高豐度-TOP2/TOP14) | 50 μL | |
腦脊液(不去除高豐度) | 200 μL | |
腦脊液(去除高豐度-TOP2/TOP14) | 500 μL | |
卵泡液(不去高豐度) | 200 μL | |
卵泡液(去除高豐度-伯樂)、尿液,精液 | 2 mL | |
淋巴液、關(guān)節(jié)液、穿刺液、腹水 | 5 mL | |
唾液/淚液/乳汁 | 1 mL | |
培養(yǎng)基上清(不能使用含血清的培養(yǎng)基) | 10 mL | |
FFPE | 每片厚度10 μm,面積1.5×2 cm | 10-15片 |
其他 | 蛋白溶液(最佳Buffer是8M Urea) | 30 μg |
使用不同的標(biāo)記試劑對(duì)不用的樣本進(jìn)行標(biāo)記,使肽段上帶上不同的標(biāo)簽,但是總質(zhì)量保持一致,因此不同樣本中的同一肽段的理化性質(zhì)是一致的,在液相色譜中在同一個(gè)保留時(shí)間流出。在二級(jí)質(zhì)譜中,標(biāo)記試劑和肽段間的化學(xué)鍵發(fā)生斷裂,報(bào)告離子峰被質(zhì)譜采集到,報(bào)告離子的峰面積即能反映出某肽段在當(dāng)前樣本的含量,因此通過比較不同報(bào)告離子的峰面積就能找到某個(gè)肽段在不用樣本中的表達(dá)差異。
通過試劑對(duì)不同來源樣品進(jìn)行標(biāo)記,實(shí)現(xiàn)不同樣品間蛋白質(zhì)組比較,一次性完成全部樣品的定性定量分析,降低了實(shí)驗(yàn)誤差,排除儀器造成的樣本間差異,穩(wěn)定性更高,操作簡(jiǎn)單,數(shù)據(jù)分析流程簡(jiǎn)單,適用于所有物種蛋白的定量分析。
因?yàn)門MT試劑特點(diǎn),樣本實(shí)際的差異倍數(shù)會(huì)有壓縮現(xiàn)象。因此差異倍數(shù)一般在1.2,就可以說明差異足夠明顯,而LFQ、DIA一般差異倍數(shù)可達(dá)到1.5倍。
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