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CHARACTERISTIC

技術(shù)特點(diǎn)

  • 檢測(cè)通量

一次性檢測(cè)6-18個(gè)樣本,大隊(duì)列樣本需每批加入1-2個(gè)相同樣本作為內(nèi)參;

  • 適用范圍

擅長(zhǎng)復(fù)雜樣本定量分析,不適用于不同組織器官類型樣本混合檢測(cè);

  • 重復(fù)性好

所有樣本混合上機(jī),同時(shí)進(jìn)行質(zhì)譜檢測(cè);

  • 缺失值少

為后續(xù)生物信息學(xué)分析提供豐富的數(shù)據(jù);

  • 注意事項(xiàng)

具有比值壓縮效應(yīng),蛋白質(zhì)差異倍數(shù)有一定程度壓縮。

APPLICATIONS

應(yīng)用方向

ADVANTAGES

服務(wù)優(yōu)勢(shì)

服務(wù)選擇多樣

提供timsTOF HT、timsTOF Pro2、Orbitrap Astral、Orbitrap Exploris? 480、Q Exactive HF-X、Orbitrap Eclipse等多種質(zhì)譜平臺(tái)選擇;

提供DIA、dDIA、LFQ、TMT等多種定量方法選擇。

項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)豐富

  • 項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)涵蓋多物種、多組織器官類型及多疾病類型,包括:

  • 100+種人類器官、組織、細(xì)胞及疾病類型;

  • 60+種小鼠器官、組織、細(xì)胞及疾病類型;

  • 60+種醫(yī)學(xué)、農(nóng)牧領(lǐng)域模式動(dòng)物及非常見動(dòng)物樣本;

  • 60+種藥物、農(nóng)牧領(lǐng)域模式植物及非常見植物樣本;

  • 60+種細(xì)菌、真菌等微生物樣本。


項(xiàng)目文章豐富

與100+所醫(yī)院、研究所等單位建立深度合作;

合作文章累積影響因子300+,發(fā)表于多部醫(yī)學(xué)、生物學(xué)、植物等領(lǐng)域期刊。

  • 服務(wù)選擇多樣

  • 項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)豐富

  • 項(xiàng)目文章豐富

MEASURED DATA

實(shí)測(cè)數(shù)據(jù)

青蓮百奧3D定量蛋白質(zhì)組實(shí)測(cè)數(shù)據(jù)

ANALYSIS PROCESS

分析流程

定量蛋白質(zhì)組生信分析流程

RESULT DISPLAY

結(jié)果展示

定量蛋白質(zhì)組結(jié)果展示

CLASSIC CASES

經(jīng)典案例

合作文章|菟絲子與其寄主植物之間廣泛的植物間蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)移

發(fā)表期刊:Molecular Plant
影響因子:17.1
發(fā)表單位:中國(guó)科學(xué)院昆明植物研究所
發(fā)表時(shí)間:2019.12.05

查看詳情
SAMPLE REQUIREMENTS

樣本要求

樣本類型送樣量
動(dòng)物組織常規(guī)組織(腦、心、肝、脾、肺、腎、肌肉等柔軟組織)20 mg
堅(jiān)硬組織(軟骨、毛發(fā))200 mg
植物組織柔軟組織(木本植物的葉、花等,草本植物,藻類,蕨類植物)300 mg
堅(jiān)硬組織(根、樹皮、樹枝,果實(shí)種子等)3 g
微生物常見細(xì)菌、真菌菌體(菌體沉淀)、精細(xì)胞50 μL
細(xì)胞懸浮/貼壁培養(yǎng)細(xì)胞(細(xì)胞計(jì)數(shù)/沉淀)5×106或20 μL
液體類血漿/血清(不去除高豐度)10 μL
血漿/血清(去除高豐度-伯樂)300 μL
血漿/血清(去除高豐度-TOP2/TOP14)50 μL
腦脊液(不去除高豐度)200 μL
腦脊液(去除高豐度-TOP2/TOP14)500 μL
卵泡液(不去高豐度)200 μL
卵泡液(去除高豐度-伯樂)、尿液,精液2 mL
淋巴液、關(guān)節(jié)液、穿刺液、腹水5 mL
唾液/淚液/乳汁1 mL
培養(yǎng)基上清(不能使用含血清的培養(yǎng)基)10 mL
FFPE每片厚度10 μm,面積1.5×2 cm10-15片
其他蛋白溶液(最佳Buffer是8M Urea)30 μg


FAQ

常見問題

  • TMT的標(biāo)記定量原理是什么?

    使用不同的標(biāo)記試劑對(duì)不用的樣本進(jìn)行標(biāo)記,使肽段上帶上不同的標(biāo)簽,但是總質(zhì)量保持一致,因此不同樣本中的同一肽段的理化性質(zhì)是一致的,在液相色譜中在同一個(gè)保留時(shí)間流出。在二級(jí)質(zhì)譜中,標(biāo)記試劑和肽段間的化學(xué)鍵發(fā)生斷裂,報(bào)告離子峰被質(zhì)譜采集到,報(bào)告離子的峰面積即能反映出某肽段在當(dāng)前樣本的含量,因此通過比較不同報(bào)告離子的峰面積就能找到某個(gè)肽段在不用樣本中的表達(dá)差異。

  • TMT蛋白組學(xué)分析的優(yōu)點(diǎn)是什么?

    通過試劑對(duì)不同來源樣品進(jìn)行標(biāo)記,實(shí)現(xiàn)不同樣品間蛋白質(zhì)組比較,一次性完成全部樣品的定性定量分析,降低了實(shí)驗(yàn)誤差,排除儀器造成的樣本間差異,穩(wěn)定性更高,操作簡(jiǎn)單,數(shù)據(jù)分析流程簡(jiǎn)單,適用于所有物種蛋白的定量分析。

  • 標(biāo)記定量為何差異倍數(shù)會(huì)偏?。?/span>

    因?yàn)門MT試劑特點(diǎn),樣本實(shí)際的差異倍數(shù)會(huì)有壓縮現(xiàn)象。因此差異倍數(shù)一般在1.2,就可以說明差異足夠明顯,而LFQ、DIA一般差異倍數(shù)可達(dá)到1.5倍。

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