TMT?（Tandem Mass Tag?）是由Thermo Scientific公司研發(fā)的多肽體外標記技術(shù)，能夠采用2-18個穩(wěn)定同位素標簽高效標記來自不同樣本的蛋白質(zhì)酶解產(chǎn)生的肽段。將標記的肽段混合進行質(zhì)譜檢測，在二級質(zhì)譜中肽段上的TMT標簽會優(yōu)先碎裂產(chǎn)生具有不同質(zhì)荷比的報告離子信號峰，據(jù)此可以獲得同一肽段在不同樣本中的表達差異。
檢測通量
一次性檢測6-18個樣本，大隊列樣本需每批加入1-2個相同樣本作為內(nèi)參；
適用范圍
擅長復(fù)雜樣本定量分析，不適用于不同組織器官類型樣本混合檢測；
重復(fù)性好
所有樣本混合上機，同時進行質(zhì)譜檢測；
缺失值少
為后續(xù)生物信息學(xué)分析提供豐富的數(shù)據(jù)；
注意事項
具有比值壓縮效應(yīng)，蛋白質(zhì)差異倍數(shù)有一定程度壓縮。
臨床大隊列樣本的疾病分型、生物標志物發(fā)現(xiàn)；生理、病理及感染免疫的機制研究；藥物的研發(fā)與藥效評估
動植物的生長發(fā)育、遺傳育種及生態(tài)保護研究；生物對環(huán)境的適應(yīng)及脅迫抗逆的機制研究；營養(yǎng)與飼料成分的分析與優(yōu)化
食品營養(yǎng)價值與品質(zhì)的分析鑒定；產(chǎn)品成分的分析與優(yōu)化；食品安全的提升
提供timsTOF HT、timsTOF Pro2、Orbitrap Astral、Orbitrap Exploris? 480、Q Exactive HF-X、Orbitrap Eclipse等多種質(zhì)譜平臺選擇；
提供DIA、dDIA、LFQ、TMT等多種定量方法選擇。
項目經(jīng)驗涵蓋多物種、多組織器官類型及多疾病類型，包括：
100+種人類器官、組織、細胞及疾病類型；
60+種小鼠器官、組織、細胞及疾病類型；
60+種醫(yī)學(xué)、農(nóng)牧領(lǐng)域模式動物及非常見動物樣本；
60+種藥物、農(nóng)牧領(lǐng)域模式植物及非常見植物樣本；
60+種細菌、真菌等微生物樣本。
與100+所醫(yī)院、研究所等單位建立深度合作；
合作文章累積影響因子300+，發(fā)表于多部醫(yī)學(xué)、生物學(xué)、植物等領(lǐng)域期刊。
發(fā)表期刊：Molecular Plant
影響因子：17.1
發(fā)表單位：中國科學(xué)院昆明植物研究所
發(fā)表時間：2019.12.05
| 樣本類型 | 送樣量 | |
| 動物組織 | 常規(guī)組織（腦、心、肝、脾、肺、腎、肌肉等柔軟組織） | 20 mg |
| 堅硬組織（軟骨、毛發(fā)） | 200 mg | |
| 植物組織 | 柔軟組織（木本植物的葉、花等，草本植物，藻類，蕨類植物） | 300 mg |
| 堅硬組織（根、樹皮、樹枝，果實種子等） | 3 g | |
| 微生物 | 常見細菌、真菌菌體（菌體沉淀）、精細胞 | 50 μL |
| 細胞 | 懸浮/貼壁培養(yǎng)細胞（細胞計數(shù)/沉淀） | 5×106或20 μL |
| 液體類 | 血漿/血清（不去除高豐度） | 10 μL |
| 血漿/血清（去除高豐度-伯樂） | 300 μL | |
| 血漿/血清（去除高豐度-TOP2/TOP14） | 50 μL | |
| 腦脊液（不去除高豐度） | 200 μL | |
| 腦脊液(去除高豐度-TOP2/TOP14) | 500 μL | |
| 卵泡液（不去高豐度） | 200 μL | |
| 卵泡液（去除高豐度-伯樂）、尿液，精液 | 2 mL | |
| 淋巴液、關(guān)節(jié)液、穿刺液、腹水 | 5 mL | |
| 唾液/淚液/乳汁 | 1 mL | |
| 培養(yǎng)基上清（不能使用含血清的培養(yǎng)基） | 10 mL | |
| FFPE | 每片厚度10 μm，面積1.5×2 cm | 10-15片 |
| 其他 | 蛋白溶液（最佳Buffer是8M Urea） | 30 μg |
使用不同的標記試劑對不用的樣本進行標記，使肽段上帶上不同的標簽，但是總質(zhì)量保持一致，因此不同樣本中的同一肽段的理化性質(zhì)是一致的，在液相色譜中在同一個保留時間流出。在二級質(zhì)譜中，標記試劑和肽段間的化學(xué)鍵發(fā)生斷裂，報告離子峰被質(zhì)譜采集到，報告離子的峰面積即能反映出某肽段在當前樣本的含量，因此通過比較不同報告離子的峰面積就能找到某個肽段在不用樣本中的表達差異。
通過試劑對不同來源樣品進行標記，實現(xiàn)不同樣品間蛋白質(zhì)組比較，一次性完成全部樣品的定性定量分析，降低了實驗誤差，排除儀器造成的樣本間差異，穩(wěn)定性更高，操作簡單，數(shù)據(jù)分析流程簡單，適用于所有物種蛋白的定量分析。
因為TMT試劑特點，樣本實際的差異倍數(shù)會有壓縮現(xiàn)象。因此差異倍數(shù)一般在1.2，就可以說明差異足夠明顯，而LFQ、DIA一般差異倍數(shù)可達到1.5倍。
增加離子淌度（ion mobility）分離，帶來蛋白質(zhì)組學(xué)在鑒定深度、檢測周期、定量準確性等性能上的革命性提升
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平行反應(yīng)監(jiān)測（PRM）能夠?qū)δ繕说鞍踪|(zhì)或肽段進行選擇性檢測，不受抗體與種屬限制，是質(zhì)譜界的Western blot
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