數(shù)據(jù)非依賴性采集（DIA）指在樣品進入二級質(zhì)譜時按照設(shè)定的質(zhì)荷比（m/z）范圍對范圍內(nèi)所有母離子進行碎片化。DIA方法不依賴信號強度進行母離子挑選，得到的數(shù)據(jù)量龐大且復(fù)雜，因此需要搜索預(yù)先對少量樣本通過數(shù)據(jù)依賴性采集（DDA）方法檢測構(gòu)建的數(shù)據(jù)庫進行準確匹配，從而提高鑒定準確性。Direct DIA，即DDA-free DIA（dDIA）能夠利用機器深度學(xué)習(xí)直接通過搜索DIA原始譜圖生成數(shù)據(jù)庫，不用再進行DDA建庫。dDIA能夠通過深度學(xué)習(xí)打分尋找譜峰碎裂規(guī)律，預(yù)測保留時間，去除假陽性結(jié)果，在保留DIA優(yōu)勢的同時提高了效率。
極高通量
擅長大隊列樣本定量分析
廣泛適用
適用于各種樣本，可分批送樣
準確性高
不依賴信號強度進行母離子挑選，為后續(xù)的生物信息學(xué)分析提供豐富的數(shù)據(jù)
重復(fù)性好
使用內(nèi)標校正肽段（iRT KIT）對不同樣品的保留時間進行校正，適合珍貴樣本
注意事項
DIA定量蛋白質(zhì)組需要DDA建庫，16個樣本以下需額外支付建庫費用，dDIA定量蛋白質(zhì)組無需建庫
臨床大隊列樣本的疾病分型、生物標志物發(fā)現(xiàn)；生理、病理及感染免疫的機制研究；藥物的研發(fā)與藥效評估
動植物的生長發(fā)育、遺傳育種及生態(tài)保護研究；生物對環(huán)境的適應(yīng)及脅迫抗逆的機制研究；營養(yǎng)與飼料成分的分析與優(yōu)化
食品營養(yǎng)價值與品質(zhì)的分析鑒定；產(chǎn)品成分的分析與優(yōu)化；食品安全的提升
項目經(jīng)驗涵蓋多物種、多組織器官類型及多疾病類型，包括：
100+種人類器官、組織、細胞及疾病類型；
60+種小鼠器官、組織、細胞及疾病類型；
60+種醫(yī)學(xué)、農(nóng)牧領(lǐng)域模式動物及非常見動物樣本；
60+種藥物、農(nóng)牧領(lǐng)域模式植物及非常見植物樣本；
60+種細菌、真菌等微生物樣本。
與100+所醫(yī)院、研究所等單位建立深度合作；
合作文章累積影響因子300+，發(fā)表于多部醫(yī)學(xué)、生物學(xué)、植物等領(lǐng)域期刊。
提供timsTOF HT、timsTOF Pro2、Orbitrap Astral、Orbitrap Exploris? 480、Q Exactive HF-X、Orbitrap Eclipse等多種質(zhì)譜平臺選擇；
提供DIA、dDIA、LFQ、TMT等多種定量方法選擇。
發(fā)表期刊：Molecular Plant
影響因子：17.1
發(fā)表單位：中國科學(xué)院昆明植物研究所
發(fā)表時間：2019.12.05
| 樣本類型 | 送樣量 | |
| 動物組織 | 常規(guī)組織（腦、心、肝、脾、肺、腎、肌肉等柔軟組織） | 10 mg |
| 堅硬組織（軟骨、毛發(fā)） | 100 mg | |
| 植物組織 | 柔軟組織（木本植物的葉、花等，草本植物，藻類，蕨類植物） | 200 mg |
| 堅硬組織（根、樹皮、樹枝，果實種子等） | 2 g | |
| 微生物 | 常見細菌、真菌菌體（菌體沉淀）、精細胞 | 30 μL |
| 細胞 | 懸浮/貼壁培養(yǎng)細胞（細胞計數(shù)/沉淀） | 2×106或20 μL |
| 液體類 | 血漿/血清（不去除高豐度） | 5 μL |
| 血漿/血清（去除高豐度-伯樂） | 100 μL | |
| 血漿/血清（去除高豐度-TOP2/TOP14） | 50 μL | |
| 血漿/血清（去除高豐度-DMB蛋白冠） | 50 μL | |
| 腦脊液（不去除高豐度） | 100 μL | |
| 腦脊液(去除高豐度-TOP2/TOP14) | 300 μL | |
| 卵泡液（不去高豐度） | 100 μL | |
| 卵泡液（去除高豐度-伯樂）、尿液，精液 | 1 mL | |
| 淋巴液、關(guān)節(jié)液、穿刺液、腹水 | 3 mL | |
| 唾液/淚液/乳汁 | 500 μL | |
| 培養(yǎng)基上清（不能使用含血清的培養(yǎng)基） | 5 mL | |
| FFPE | 每片厚度10 μm，面積1.5×2 cm | 2-5片 |
| 其他 | 蛋白溶液（最佳Buffer是8M Urea） | 10 μg |
傳統(tǒng)的DDA技術(shù)依賴于一級質(zhì)譜中母離子的峰強度選擇信號強度排名在前幾位的母離子進行二級質(zhì)譜檢測，DIA技術(shù)將質(zhì)譜整個全掃描范圍分為若干個窗口，對每個窗口中的所有離子進行選擇、碎裂、檢測，從而無遺漏、無差異地獲得樣本中所有離子的全部碎片信息。
DIA的全掃描方式獲得的數(shù)據(jù)過于復(fù)雜，其每張二級譜圖中混合了來自于多個一級信號的信息，通常難以直接進行理論庫匹配，一般需要先進行DDA建庫輔助對DIA數(shù)據(jù)進行高效、準確地解析。
不過隨著機器深度學(xué)習(xí)技術(shù)的發(fā)展，目前spectronaut搜庫軟件支持DIA數(shù)據(jù)直接搜庫，檢出數(shù)據(jù)已達到與傳統(tǒng)的建庫方法相近的水平。
DIA是全息掃描模式，能全面記錄樣本信息，定量準確性大大提高，重復(fù)性好，缺失值少，樣本采集時加入了保留時間校正同位素肽段，適合大隊列樣本，上機時間間隔可以較大，可分批送樣，數(shù)據(jù)可回溯。
增加離子淌度（ion mobility）分離，帶來蛋白質(zhì)組學(xué)在鑒定深度、檢測周期、定量準確性等性能上的革命性提升
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平行反應(yīng)監(jiān)測（PRM）能夠?qū)δ繕说鞍踪|(zhì)或肽段進行選擇性檢測，不受抗體與種屬限制，是質(zhì)譜界的Western blot
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