青蓮百奧將自主研發(fā)的血漿低豐度蛋白富集磁珠試劑盒、全流程自動化前處理機器人和高通量timsTOF HT質(zhì)譜儀結(jié)合,克服血漿樣品復(fù)雜性高、低豐度蛋白檢測深度低的難題,成功將血漿蛋白質(zhì)組的檢測深度提升至6000+,為血漿蛋白質(zhì)組學(xué)研究帶來革命性的突破!
借助“蛋白冠”及Vorman效應(yīng),使更強結(jié)合親和力的蛋白與早期吸附的蛋白發(fā)生競爭性置換,針對生物樣本中的低豐度蛋白進行高效富集。
MagicOmics DMB試劑盒不僅可以廣泛應(yīng)用于血漿血清、腦脊液、尿液、細胞上清液等樣本類型而且適用于人、鼠、兔、羊、牛等不同物種。
在人群隊列中進行基因組和蛋白組分析,通過全基因組關(guān)聯(lián)分析篩選疾病遺傳關(guān)聯(lián)蛋白,進一步研究候選位點功能機制及調(diào)控網(wǎng)絡(luò),探索疾病的作用機制和潛在治療靶點
通過發(fā)現(xiàn)隊列及驗證隊列篩選出與疾病相關(guān)的蛋 白質(zhì),可應(yīng)用于疾病的診斷、分期和預(yù)后治療
分析患者在發(fā)病過程或患者與對照間血漿蛋白質(zhì) 的變化,尋找差異表達蛋白并進行功能分析,進一步揭示疾病的發(fā)病機制
全流程全自動化樣本前處理結(jié)合最新高分辨質(zhì)譜儀timsTOF HT進行蛋白質(zhì)組學(xué)檢測,助力生物標(biāo)志物的開拓
普通深度、高深度最低僅需50uL血漿樣本;
最快10個工作日交付結(jié)果。
技術(shù)成果發(fā)表在《Analytica Chimica Acta》、《質(zhì)譜學(xué)報》。兩篇文章對市面上多種低豐度蛋白富集的方法進行了測試,結(jié)果表明DMB試劑盒能夠富集更多的血漿、血清低豐度蛋白,助力血液蛋白標(biāo)志物的發(fā)現(xiàn)。
血漿蛋白質(zhì)組生物信息分析:標(biāo)準(zhǔn)分析+血漿特色分析+高級分析
高級分析:
標(biāo)志物篩選:機器學(xué)習(xí)算法篩選蛋白標(biāo)志物
PWAS:全蛋白質(zhì)組關(guān)聯(lián)分析
多組學(xué)聯(lián)合分析:蛋白質(zhì)組代謝組聯(lián)合分析;蛋白質(zhì)組轉(zhuǎn)錄組聯(lián)合分析
利用自主研發(fā)的血漿低豐度蛋白富集磁珠試劑盒(MagicOmics-DMB)對血漿樣本中的低豐度蛋白進行富集,使用自主研發(fā)的全流程自動化前處理機器人(MagicOmics-AP-96)進行樣本制備,然后使用高通量timsTOF HT質(zhì)譜儀進行蛋白質(zhì)檢測,實現(xiàn)血漿蛋白質(zhì)組超高深度覆蓋。與富集前的血漿樣本相比,利用MagicOmics-DMB富集樣本的蛋白質(zhì)鑒定數(shù)目大大提升,從富集前的409個蛋白質(zhì),提升至富集后的6071個。
發(fā)表期刊:Analytica Chimica Acta
影響因子:5.7
發(fā)表單位:中國人民解放軍總醫(yī)院&青蓮百奧
發(fā)表時間:2023.07.04
發(fā)表期刊:質(zhì)譜學(xué)報
影響因子:/
發(fā)表單位:中國計量大學(xué)
發(fā)表時間:2024.03.19
樣本類型 | LFQ/ DIA/PRM | TMT | 內(nèi)源性多肽 | HILIC糖基化 |
血漿/血清/(不去除高豐度) | 5μL | 10 μL | 200μL | 10μL |
血漿/血清/(去除高豐度-伯樂) | 100 μL | 300μL | 500μL | / |
血漿/血清(去除高豐度-TOP2/TOP14) | 50μL | 50μL | 500μL | / |
血漿/血清(去除高豐度-DMB蛋白冠) | 50μL | / | / | 500 μL |
基于“蛋白冠”及“Vorman效應(yīng)”,通過對納米磁珠表面進行特殊的修飾,使其對血漿樣品的中、低豐度蛋白質(zhì)具有更高的親和力,以達到非特異性去除血漿高豐度蛋白質(zhì)的目的
血清:
1)使用真空采血管收集血液(不含抗凝劑,紅蓋);
2)輕輕地上下顛倒混勻 5-6 次;
3)4℃,靜置 15-30 min,1100 g 離心 10 min;
4)用移液器將上層淡黃色血清轉(zhuǎn)移到離心管中,瞬時離心。
5)液氮速凍,- 80℃短期保存,干冰寄送。
注:1)樣品制備過程中不能溶血。2)血清參考得率:30%~50%(例如:1mL全血大約能得0.3~0.5mL血清)。
血漿:
1)使用 EDTA 抗凝劑(空采血管帽蓋為紫色)的血常規(guī)管采集血液(不能使用含有肝素抗凝劑的采血管);
2)輕輕地上下顛倒混勻 8-10 次; 立即 4℃,1200 g 離心 10min;
3)用移液器將血漿轉(zhuǎn)移到離心管中,瞬時離心。
4)液氮速凍,- 80℃短期保存,干冰寄送。
注:1)如果血漿樣本需要去除高豐度蛋白,在收集樣本時不能使用肝素抗凝劑,只能使用EDTA等其他抗凝劑。2)血漿參考得率:約50%(例如:1mL 全血大約能得 0.5mL 血漿)。
如果問題不明確,隊列越大越好。如果有特定的臨床目的,可以使用幾十例的樣本加上驗證隊列。一般在50例及以上,機器學(xué)習(xí)構(gòu)建模型的準(zhǔn)確性更高。
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